Page 11 - Adlershof Journal Mai/Juni 2018

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Dafür braucht es optimierte Suchmaschi-
nen. Doch deren Programmierung gestal-
Bei komplizierten Fällen tet sich schwierig. Das Problem beginnt
suchen Mediziner zurzeit mit dem Finden der geeigneten Suchbe-
zwischen 30 Minuten und griffe. Es ist mitnichten so, dass die Benen-
einem Tag pro Patient. nung eines Gens oder einer Mutation in
der Literatur einheitlich wäre. Ein typisches
Wir wollen Zeit sparen menschliches Gen hat ca. acht Namen, die
und das Suchergebnis oft auch extrem ähnlich zu den Namen an-
verbessern. derer Gene sind und identisch mit den Na-
men von Genen in anderen Säugetieren.
Auch eine Krankheit heißt nicht immer
gleich: Man sagt Darmkrebs oder kolo- Tumor Workbench Trial Designer Drug Predictor
rektales Karzinom, und meint es mit oder
ohne Metastasen. Ein Hauptaugenmerk Disease-Specific
Mechanistic Models Knowledge Base
„Kein Experte kann da auch nur für seinen der Forscher liegt darin, Veröffentlichun- Public mutation/
& Pathways disease databases
Bereich noch den Überblick behalten“, gen und Datenbanken zu finden, die für Scientific articles Public and
weiß Leser. „Bei komplizierten Fällen su- einen gegebenen Patienten klinische Rele- & patents Public large cancer Inhouse patient inhouse trials
chen Mediziner zurzeit zwischen 30 Minu- vanz haben. sequencing projects cohorts
ten und einem Tag pro Patient. Wir wollen
Zeit sparen und das Suchergebnis verbes- Für den Informatiker Ulf Leser sind das
Informatiker Ulf Leser erleichtert die Recherchemöglichkeiten von Medizinern sern.“ große Integrations- und Text-Mining-Pro-
bleme. Mit seinem Team entwickelt er von Tausend klinisch relevanten Studien sagen, ob sie als klinisch relevant einzu-
Speziell geht es um die Suche nach Infor- Methoden, die zum einen die relevanten lernen. Ein sogenannter Klassifikator be- ordnen ist. Das Forscherteam hat gerade
mationen zu Tumoren mit bestimmten Veröffentlichungen automatisch finden. trachtet jedes einzelne Wort und seine erste Versionen einer Suchmaschine ent-
Suchmaschinen für Genmutationen, die einer Standardthe- Und zum anderen extrahieren sie aus Häufigkeit im Text und vergleicht diese wickelt, die jetzt von Ärzten getestet und
rapie nicht oder nicht mehr zugänglich
mit Tausenden von Dokumenten, die nicht
diesen die gewünschten Informationen:
bewertet werden. „Die Genauigkeit der
sind. Hierfür werden zunehmend mole-
lich besser als bei PubMed, der de facto
ten Unterschiede kann das System dann
Medikamente etc. Dabei wenden die For-
kular genaue Wirkstoffe entwickelt, die an über Gene, Mutationen, Krankheitsnamen, klinisch relevant sind. Mittels der gelern- Ergebnisse ist vielversprechend und deut-
die personalisierte bestimmten Genen andocken, aber nur, scher Methoden des Maschine-Learning bei neuen Veröffentlichungen mit einer Standardsuchmaschine für Onkologen“,
wenn diese auf bestimmte Weise mutiert
resümiert Leser. ud
an. Sie lassen die Software an einem Set
bestimmten Wahrscheinlichkeit vorher-
sind (oder nicht) – sonst wirkt das Medika-
Onkologie ment nicht. ANZEIGE
Wird das Genom eines Tumors sequen-
ziert, ergibt sich eine Liste von einigen Dut-
zend bis Tausenden Mutationen. Aus die-
Wird bei einer Patientin ein bösartiger Tumor diagnostiziert, steht sen müssen die Ärzte dann idealerweise
die Frage nach der passenden Behandlung an: Operation, Therapie – die entscheidenden fünf bis zehn heraus-
kristallisieren, die einen Ansatzpunkt für
und welche? Professor Ulf Leser und sein Lehrstuhl für Wissens- die Behandlung liefern. „Diesen Kristalli-
management in der Bioinformatik am Institut für Informatik der sationsprozess zu unterstützen, ist das Ziel
Humboldt-Universität zu Berlin will mit der Entwicklung spezieller unserer Projekte PERSONS und PREDICT,
Suchmaschinen Mediziner bei dieser Entscheidung unterstützen. die beide aus interdisziplinären Teams
Die Software kann aus der Vielzahl medizinischer Publikationen bestehen“, sagt Leser. Neben der Berliner unverbindliche Visualisierung unverbindliche Visualisierung
und Datenbanken gezielt solche heraussuchen, die in einem spe- Charité sind unter anderem auch die Uni-
versität Tübingen und die Universitätskli-
zifischen Krankheitsfall Hinweise für eine möglichst erfolgreiche nik Tübingen beteiligt. „Unsere Software KFW-
Behandlung geben können. soll selber keine Entscheidungen treffen, EFFIZIENZ-
sondern stellt eine umfassende und ak- HAUS 40
tuelle Datenbasis zur Unterstützung der DIE KOMPASSHÄUSER IN BERLINGRÜNAU
Die Aufgabe klingt leichter, als sie ist, denn bereits gespeicherten wissenschaftlichen ärztlichen Entscheidungsfindung zur Ver- DIE NACHHALTIGE ART DES WOHNENS
mit PubMed gibt es zwar ein öffentlich zu- Papern ungefähr eine weitere Million fügung“, betont Leser. „Was weiß man • Am Ufer der Dahme und nah am Wissenschaftsstandort Adlershof entstehen
gängliches Verzeichnis aller medizinischen hinzu. Zu häufigen Tumoren forschen Hun- weltweit über die einzelnen Mutationen im Quartier 52° Nord Eigentumswohnungen in energieeffi zienten Holzhybridhäusern
Veröffentlichungen. Die dafür angebotene derte Gruppen weltweit und publizieren und ihre klinischen Implikationen, also ihre • 4 Häuser, 50 Wohnungen, ca. 79 bis 112 m Wohnfl äche
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Suchmaschine ordnet Treffer aber in erster ständig neue Erkenntnisse aus Dutzenden Auswirkungen auf den Verlauf der Krank- • Hohe Räume und große Balkone oder Terrassen
Linie chronologisch und nicht nach ihrer klinischer Studien und einer Vielzahl gro- heit? Und wie können wir dieses Wissen • Innovatives Energiekonzept durch quartierseigene Wärmeversorgung
• Zum Beispiel: 3 Zimmer, EG, ca. 82 m Wohnfl äche, 357.000 Euro, provisionsfrei direkt vom Bauträger
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medizinischen Relevanz. Und die Fülle ver- ßer Sequenzierprojekte. Das ist erfreulich, einem Arzt möglichst schnell, intuitiv, gut
fügbarer Informationen ist enorm. Jedes aber auch Teil des Dilemmas, vor dem die zusammengestellt und gut aufbereitet zur
Jahr kommen zu den aktuell 30 Millionen behandelnden Ärzte stehen. Verfügung stellen?“
Showroom: Regattastr. 11, 12527 Berlin | Sa + So 13 – 17 Uhr sowie Mi 13 – 19 Uhr u. n. V.
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